Assuntos
Betacoronavirus , Controle de Doenças Transmissíveis , Infecções por Coronavirus , Transmissão de Doença Infecciosa , Saúde Global/estatística & dados numéricos , Pandemias , Pneumonia Viral , Betacoronavirus/isolamento & purificação , Betacoronavirus/patogenicidade , COVID-19 , Controle de Doenças Transmissíveis/métodos , Controle de Doenças Transmissíveis/organização & administração , Controle de Doenças Transmissíveis/normas , Infecções por Coronavirus/epidemiologia , Infecções por Coronavirus/prevenção & controle , Infecções por Coronavirus/transmissão , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Transmissão de Doença Infecciosa/estatística & dados numéricos , Humanos , Internacionalidade , Mortalidade , Pandemias/prevenção & controle , Pneumonia Viral/epidemiologia , Pneumonia Viral/prevenção & controle , Pneumonia Viral/transmissão , Melhoria de Qualidade , SARS-CoV-2Assuntos
Número Básico de Reprodução/estatística & dados numéricos , Infecções por Coronavirus , Transmissão de Doença Infecciosa/estatística & dados numéricos , Monitoramento Epidemiológico , Pandemias , Pneumonia Viral , Betacoronavirus/isolamento & purificação , Viés , COVID-19 , Infecções por Coronavirus/epidemiologia , Infecções por Coronavirus/prevenção & controle , Infecções por Coronavirus/transmissão , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Medidas em Epidemiologia , Saúde Global , Humanos , Pandemias/prevenção & controle , Pandemias/estatística & dados numéricos , Pneumonia Viral/epidemiologia , Pneumonia Viral/prevenção & controle , Pneumonia Viral/transmissão , SARS-CoV-2 , Suíça/epidemiologiaRESUMO
Following the rapid dissemination of COVID-19 cases in Switzerland, large-scale non-pharmaceutical interventions (NPIs) were implemented by the cantons and the federal government between 28 February and 20 March 2020. Estimates of the impact of these interventions on SARS-CoV-2 transmission are critical for decision making in this and future outbreaks. We here aim to assess the impact of these NPIs on disease transmission by estimating changes in the basic reproduction number (R0) at national and cantonal levels in relation to the timing of these NPIs. We estimated the time-varying R0 nationally and in eleven cantons by fitting a stochastic transmission model explicitly simulating within-hospital dynamics. We used individual-level data from more than 1000 hospitalised patients in Switzerland and public daily reports of hospitalisations and deaths. We estimated the national R0 to be 2.8 (95% confidence interval 2.1–3.8) at the beginning of the epidemic. Starting from around 7 March, we found a strong reduction in time-varying R0 with a 86% median decrease (95% quantile range [QR] 79–90%) to a value of 0.40 (95% QR 0.3–0.58) in the period of 29 March to 5 April. At the cantonal level, R0 decreased over the course of the epidemic between 53% and 92%. Reductions in time-varying R0 were synchronous with changes in mobility patterns as estimated through smartphone activity, which started before the official implementation of NPIs. We inferred that most of the reduction of transmission is attributable to behavioural changes as opposed to natural immunity, the latter accounting for only about 4% of the total reduction in effective transmission. As Switzerland considers relaxing some of the restrictions of social mixing, current estimates of time-varying R0 well below one are promising. However, as of 24 April 2020, at least 96% (95% QR 95.7–96.4%) of the Swiss population remains susceptible to SARS-CoV-2. These results warrant a cautious relaxation of social distance practices and close monitoring of changes in both the basic and effective reproduction numbers.
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Betacoronavirus/isolamento & purificação , Controle de Doenças Transmissíveis , Infecções por Coronavirus , Transmissão de Doença Infecciosa , Pandemias/estatística & dados numéricos , Pneumonia Viral , COVID-19 , Controle de Doenças Transmissíveis/métodos , Controle de Doenças Transmissíveis/organização & administração , Controle de Doenças Transmissíveis/estatística & dados numéricos , Doenças Transmissíveis Emergentes/prevenção & controle , Infecções por Coronavirus/epidemiologia , Infecções por Coronavirus/prevenção & controle , Infecções por Coronavirus/transmissão , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Transmissão de Doença Infecciosa/estatística & dados numéricos , Hospitalização/estatística & dados numéricos , Humanos , Modelos Estatísticos , Mortalidade , Pandemias/prevenção & controle , Pneumonia Viral/epidemiologia , Pneumonia Viral/prevenção & controle , Pneumonia Viral/transmissão , SARS-CoV-2 , Conglomerados Espaço-Temporais , Processos EstocásticosAssuntos
Betacoronavirus , Infecções por Coronavirus/epidemiologia , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Pandemias , Pneumonia Viral/epidemiologia , Quarentena/métodos , Universidades , COVID-19 , Infecções por Coronavirus/transmissão , Saúde Global , Humanos , Pneumonia Viral/transmissão , SARS-CoV-2Assuntos
Betacoronavirus , Infecções por Coronavirus/epidemiologia , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Guias como Assunto , Máscaras/estatística & dados numéricos , Pandemias/prevenção & controle , Pneumonia Viral/epidemiologia , COVID-19 , Infecções por Coronavirus/transmissão , Humanos , Pneumonia Viral/transmissão , SARS-CoV-2 , Estados Unidos/epidemiologiaAssuntos
Teste para COVID-19/métodos , COVID-19/transmissão , Transmissão de Doença Infecciosa/estatística & dados numéricos , Equipe de Assistência ao Paciente , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/prevenção & controle , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Humanos , Comunicação Interdisciplinar , Estados Unidos/epidemiologiaAssuntos
COVID-19 , Pessoal de Saúde , Controle de Infecções , Estresse Ocupacional , Gestão de Riscos/métodos , Bangladesh/epidemiologia , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/prevenção & controle , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Necessidades e Demandas de Serviços de Saúde/tendências , Humanos , Controle de Infecções/métodos , Controle de Infecções/organização & administração , Saúde Ocupacional/normas , Saúde Ocupacional/tendências , Estresse Ocupacional/epidemiologia , Estresse Ocupacional/prevenção & controle , SARS-CoV-2Assuntos
Infecções Assintomáticas , COVID-19 , Controle de Doenças Transmissíveis , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , SARS-CoV-2/isolamento & purificação , Infecções Assintomáticas/epidemiologia , Infecções Assintomáticas/terapia , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/prevenção & controle , COVID-19/virologia , Controle de Doenças Transmissíveis/métodos , Controle de Doenças Transmissíveis/organização & administração , Humanos , Determinação de Necessidades de Cuidados de Saúde , Saúde Ocupacional/normas , Saúde Pública/normas , SARS-CoV-2/fisiologiaAssuntos
Teste para COVID-19/métodos , COVID-19 , Busca de Comunicante/métodos , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Características da Família , SARS-CoV-2/isolamento & purificação , Infecções Assintomáticas/epidemiologia , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/prevenção & controle , Controle de Doenças Transmissíveis/métodos , Países em Desenvolvimento , Habitação , Humanos , Paquistão/epidemiologia , Saúde Pública/métodosAssuntos
Teste para COVID-19/métodos , COVID-19 , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Controle de Infecções , Retorno ao Trabalho , SARS-CoV-2/isolamento & purificação , Local de Trabalho , Adulto , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/prevenção & controle , COVID-19/transmissão , Feminino , Pessoal de Saúde , Mão de Obra em Saúde/estatística & dados numéricos , Humanos , Controle de Infecções/métodos , Controle de Infecções/organização & administração , Masculino , Massachusetts/epidemiologia , Saúde Ocupacional , Gestão da Segurança/organização & administração , Local de Trabalho/organização & administração , Local de Trabalho/normasAssuntos
Teste para COVID-19 , COVID-19 , Pessoal de Saúde , Hospitais Pediátricos/estatística & dados numéricos , Exposição Ocupacional , SARS-CoV-2/isolamento & purificação , Adulto , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/prevenção & controle , Teste para COVID-19/métodos , Teste para COVID-19/estatística & dados numéricos , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Feminino , Pessoal de Saúde/classificação , Pessoal de Saúde/estatística & dados numéricos , Humanos , Controle de Infecções/métodos , Itália/epidemiologia , Masculino , Exposição Ocupacional/análise , Exposição Ocupacional/prevenção & controle , Prevalência , Estudos SoroepidemiológicosAssuntos
COVID-19 , Controle de Doenças Transmissíveis , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/prevenção & controle , Controle de Doenças Transmissíveis/métodos , Controle de Doenças Transmissíveis/organização & administração , Busca de Comunicante/métodos , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Transmissão de Doença Infecciosa/estatística & dados numéricos , Humanos , Irã (Geográfico)/epidemiologia , Determinação de Necessidades de Cuidados de Saúde , Distanciamento Físico , Prevalência , SARS-CoV-2/isolamento & purificaçãoAssuntos
Abdome Agudo , COVID-19 , Meningite , Miocardite , Pediatria , Sepse , Síndrome de Resposta Inflamatória Sistêmica , Abdome Agudo/diagnóstico , Abdome Agudo/etiologia , COVID-19/diagnóstico , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/fisiopatologia , COVID-19/prevenção & controle , COVID-19/terapia , Criança , Controle de Doenças Transmissíveis/métodos , Diagnóstico Diferencial , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Serviços Médicos de Emergência/métodos , Serviços Médicos de Emergência/organização & administração , Humanos , Meningite/diagnóstico , Meningite/etiologia , Miocardite/diagnóstico , Miocardite/etiologia , Pediatria/métodos , Pediatria/organização & administração , Pediatria/normas , Infecções Respiratórias/diagnóstico , Infecções Respiratórias/virologia , SARS-CoV-2 , Sepse/diagnóstico , Sepse/etiologia , Avaliação de Sintomas/métodos , Síndrome de Resposta Inflamatória Sistêmica/diagnóstico , Síndrome de Resposta Inflamatória Sistêmica/fisiopatologia , Síndrome de Resposta Inflamatória Sistêmica/terapia , Estados Unidos/epidemiologiaAssuntos
Betacoronavirus , Infecções por Coronavirus/epidemiologia , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Guias como Assunto , Pandemias/prevenção & controle , Equipamento de Proteção Individual/provisão & distribuição , Pneumonia Viral/epidemiologia , COVID-19 , Infecções por Coronavirus/transmissão , Humanos , Pneumonia Viral/transmissão , SARS-CoV-2RESUMO
In response to the COVID19 pandemic, many countries have implemented lockdowns in multiple phases to ensure social distancing and quarantining of the infected subjects. Subsequent unlocks to reopen the economies started next waves of infection and imposed an extra burden on quarantine to keep the reproduction number ([Formula: see text]) < 1. However, most countries could not effectively contain the infection spread, suggesting identification of the potential sources weakening the effect of lockdowns could help design better informed lockdown-unlock cycles in the future. Here, through building quantitative epidemic models and analyzing the metadata of 50 countries from across the continents we first found that the estimated value of [Formula: see text], adjusted w.r.t the distribution of medical facilities and virus clades correlates strongly with the testing rates in a country. Since the testing capacity of a country is limited by its medical resources, we investigated if a cost-benefit trade-off can be designed connecting testing rate and extent of unlocking. We present a strategy to optimize this trade-off in a country specific manner by providing a quantitative estimate of testing and quarantine rates required to allow different extents of unlocks while aiming to maintain [Formula: see text]. We further show that a small fraction of superspreaders can dramatically increase the number of infected individuals even during strict lockdowns by strengthening the positive feedback loop driving infection spread. Harnessing the benefit of optimized country-specific testing rates would critically require minimizing the movement of these superspreaders via strict social distancing norms, such that the positive feedback driven switch-like exponential spread phase of infection can be avoided/delayed.
Assuntos
COVID-19/prevenção & controle , Busca de Comunicante , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Modelos Epidemiológicos , Distanciamento Físico , Quarentena , SARS-CoV-2/crescimento & desenvolvimento , Replicação Viral , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/transmissão , COVID-19/virologia , Teste para COVID-19 , Portador Sadio , Humanos , Metadados , SARS-CoV-2/patogenicidade , Fatores de TempoAssuntos
COVID-19 , Controle de Doenças Transmissíveis , Transmissão de Doença Infecciosa , Características da Família , SARS-CoV-2/isolamento & purificação , Adulto , COVID-19/epidemiologia , COVID-19/prevenção & controle , COVID-19/transmissão , Teste de Ácido Nucleico para COVID-19/estatística & dados numéricos , Controle de Doenças Transmissíveis/métodos , Controle de Doenças Transmissíveis/organização & administração , Hotspot de Doença , Transmissão de Doença Infecciosa/prevenção & controle , Transmissão de Doença Infecciosa/estatística & dados numéricos , Registros Eletrônicos de Saúde/estatística & dados numéricos , Feminino , Humanos , Masculino , Massachusetts/epidemiologia , Pessoa de Meia-Idade , Medição de Risco/métodos , Fatores de RiscoRESUMO
Health care-associated infections (HAIs) account for many morbidity and mortality worldwide, with disproportionate adverse effects in low- and middle-income countries (LMIC). Many factors contribute to the impact in LMIC, including lack of infrastructure, inconsistent surveillance, deficiency in trained personnel and infection control programs, and poverty-related factors. Therefore, optimal approaches must be tailored for LMIC and balance effectiveness and cost in the control of HAIs.